Christina Aguilera nació y creció en Staten Island, Nueva York. Su padre, Fausto Wagner Aguilera, es ecuatoriano el cúal fue sargento del Ejército de los Estados Unidos.Su tía abuela es la soprano y académica musical María Victoria Aguilera Mesías originaria de Latacunga en Ecuador. Su madre, Shelly Loraine Fidler, es una irlandesa-alemana que trabajaba como maestra de español. De acuerdo a varias declaraciones y a las letras de sus canciones, Aguilera recibía maltrato psicológico y constantes abusos físicos por parte de su padre.En una entrevista al canal de televisión E!, la cantante confesó que durante su infancia vivió muchas cosas desagradables, como los golpes que propinaba su padre a su madre.30 Igualmente, agregó que nunca estuvo segura mientras crecía, y le agradece a la música por ser el método que usó para olvidar sus dolores emocionales.30 En 1989, Shelly y Fausto se divorciaron, después de diez años de matrimonio.Posteriormente, Shelly contrajo matrimonio con un paramédico llamado Jim Kearns y se cambió el nombre por Shelly Kearns. Por otra parte, Fausto le escribió una carta a Aguilera donde decía que quería hablar con ella. No obstante, la cantante negó cualquier oportunidad de verlo otra vez.

En su periodo de infancia, su carrera artística comenzó a construirse, y Aguilera ya era reconocida como «la pequeña niña de la gran voz». Pero su capacidad y talento vocal molestaban a algunos de sus vecinos, quienes la despreciaban con burlas y marginación.Poco tiempo después, Aguilera, su madre y su hermana se mudaron a un suburbio de Pittsburgh, llevando en secreto el talento de Aguilera para evitar otros actos hostiles. Tras mucho tiempo Christina  se reconcilió con su padre.

Ahora Christina t iene dos hijos: Max Liron Bratman y Summer Rain Rutler.